36·

主播丨丁教     嘉宾丨廖国春后期丨迪卡普里鑫   ShowNotes丨王雅 「硅谷早知道」第四季今天的节目依然为大家带来「疫情中的公司们」系列。我们希望能通过这个系列，分享创业者面对黑天鹅时的勇气，灵活，或许还有对这个世界的善意，并通过这些分享和大家一同面对这种不确定性。疫情发生以来，试剂盒困局似乎始终没有得到完美的解决方案。除了使用试剂盒检测有很高专业门槛外，漏检率高也是无法忽视的一个问题。这期节目我们采访了 IDbyDNA 的创始人兼 CEO 廖国春，他为我们介绍了另一种正在蓬勃发展中的微生物感染检测技术：宏基因组检测。本期节目你将听到，医疗诊断问题在大数据的背景下如何转变为计算问题；更有价值的是，宏基因组检测可能为流行病的防控打开新的局面。另外，硅谷早知道第四季已经上线，需要大家在喜马拉雅、苹果 Podcasts 等各大平台上重新订阅收听。那请大家接着关注声动活泼旗下其他节目。本期主播丁教，声动活泼联合创始人本期嘉宾廖国春，IDbyDNA 的创始人兼CEOThe takeaway宏基因组测序是把样品中所有生物的核酸拿过来不加区分的进行检测。测完之后实际上相当于把病人样品数据化了，这个时候就变成了一个计算问题，我们需要从样品上百万上千万或者更多的DNA序列片段里面找出来，哪些是从人来的，哪些是从微生物来的，哪些是有可能致病的。传统检测方法PCR具有很高的特异性，需要设计一个高特异性的探针，所以它适用于目标明确且非常了解检测对象的情况。核酸试剂盒（PCR）检测效率低有多方面的原因：在疫情早期我们对病毒的基序列所知甚少，只能根据一些已公开发表的数据来设计探针，无法保证不漏检；当前生产压力大，人手不足，试剂盒的质检无法得到充分保证；上呼吸道和痰液并不是理想的病毒采样点，对病毒核酸的采样构成挑战。宏基因组检测在流行病防控上的优势在于：第一，它可以同时检测很多病菌而不需要专门对某一种病菌采取特别措施，在大规模检测患者的时候可以在早期就发现问题。第二，测序完成后可以不仅可以判断是不是，还可以提供致病病菌的基因信息，有利于制定治疗方案，还能跟数据库里病菌进行比对，追溯传染源。基因库的数据一方面来自于公共数据库，一方面来自于检测病例分析。宏基因组测序想要保证质量，前期准备需要保证样品的制备技术和有效的内标，因为核酸是测序的基础，而内标可以判断实验流程是否完整；后